游戏的进行方式总体可以分为三种模式：
自由模式〖自由模式下，玩家以第一人称视角自由的探索岛屿。发现各种线索，装备，触发事件等。〗
剧情模式〖当触发了特殊事件或进入特殊场景后，随机顺序进入剧情模式和情景模式。进入剧情模式，将以AVG文字剧情的方式进行各个事件的主，分，隐藏剧情，起到推动故事进展作用。〗
情景模式〖事件触发后随机顺序进入剧情和情景模式。情景模式下，仍旧是自由探索，不同的是某些固定场景会有变化。根据玩家的行动而发展出各种未知分支线，人物互动或装备等。〗
虽然这款游戏还没有普及完善先进的全息拟真技术，但无疑在各种xD特效技术上，都是卓越精湛的。
为了达到更真实的游戏环境，设计者直接摒弃了一贯多视角的操作概念，只采用第一视角的方式进行游戏，配合半虚拟实镜的专用外置传感头盔和全身体感遥控装置，从而制造更加身临其境的感觉。
加上当时让很多新手困惑的情景模式……这里所谓的游戏模式前两个都很好理解，第三个就有些复杂了。
剧情模式出现方式与情景模式一样，但通常都是固定的内容，只会在某些细节产生不同的变化和描述。而情景模式的就是完全随机话了。
同样的事件，不但场景随机，流程也是完全随机。比如在剧情中，玩家在见到其他人之前，必定是先开启过序章事件——也就是见到浅山一行四人。且第一面的形势绝壁是在浅山首次凌辱树里和樱子时。但此事件出现的场景可能在地图上任何地方，触发条件与时间段以及玩家的行动和行动后果也是完全随机。
如果说，玩家在刚开始就高调行事的进入到浅山一行事件的触发范围，那么完全可能在还不明白发生什么事的时候就直接被浅山发现ko掉。
被浅山发现后的玩家将会遇到任何可能。浅山可能会直接袭击玩家，也可能无视着继续奸淫女生们。由于玩家的突然出现甚至还会发生杏子突然发疯首先攻击玩家的事情（曾经就有人玩到过这种情况。）……
总之，玩家很难预料出事件中即将发生的情况。这就是情景模式概念。
而在这些随机未知事件中，玩家所要做的最大保障，就是活下去。一旦玩家人物死亡，游戏也就Gameover。
这个游戏又一个特殊地方是，不能悔棋。
跟所有强制自动存档游戏一样，《孤岛》没有手动存档，自动存档会在每次离开和退出游戏的刷新覆盖，不管是正常还是非正常，下次进入游戏时都会在上一次中断的地方继续。
但不同一点是，玩家人物若不小心死了gameover，那就是真正的gameover。不管之前玩到哪里，已经玩了多久，都是白费。没有任何讯息和数据的保存，不留一点痕迹的，一旦死亡，只能从头开始游戏。
这种设定必然让很多习惯了S/L大法的人颇有怨言，可同时不可否认也比传统的游戏方式更加刺激和有难度。
这个设定类似一种真实的人生，多变，没有固定结局。每次人生中都不会给你犹豫不决和悔步的机会，每一次的游戏做出一样的事也会有不同的结果。
不过游戏毕竟是游戏，为了满足各方面玩家需求，游戏中还存在着一种隐藏珍稀的拯救死亡道具。获得这个道具能抵消一次死亡，同时也会付出相应的代价。据资深玩家经验统计，这个道具在游戏中只会出现三次，出现时间地点，获得条件代价都是随机，能不能把握机会得到它们全看玩家的本事。
以眼下欣悦的情况来看，就不是说说游戏或看个电影那么轻松了。
即使是现在，欣悦对自己的处境也还没有非常的确定。
欣悦是清楚的，不管是穿越游戏还是电影，这些都是人虚构出来的东西，本身的存在并不具备真实定义，但她却是真实存在的。即使她能接受自己穿越到三观尽毁的虚构世界中这种事，她也无法理清存在于这种她无法解释的现象中的含义——谁又能保证最后这不是一场侵入她脑波绝对不带好意的实验呢？通常电影里不都这样演的么。
多次元，平行世界论证？她可不是什么专业人士。
好吧未免神经错乱大概先不要想这么多复杂的东西。
事实上，不管什么情况下欣悦都不能分析出现在她该做什么不该做什么。若是死在这里代表什么，是就此在世界上永远消失，是直接回到属于她的世界，还是变成一堆数据代码？或者直接从梦中醒来……？
这世上很多人有选择困难症，欣悦也不例外。比如说现在，即使欣悦一直相信自己的直觉，而她的直觉告诉她这不是梦。她也还是……
在一个任何时候都会出现危险，威胁到生命安全的地方，她不想做出有风险的尝试性的决定，她没法承担那些她无法预测的后果。
在什么是真实什么是虚幻中不断思考回忆比较分析的欣悦觉得，自己没有精分崩溃已经很不错了。
她只能抓住一点来维持她的理智那就是：她不想死。
与游戏时那种紧张刺激不顾一切和看片时随心所欲吐槽的心情不同，她知道，不管这个世界是否真实了，对于〖真实〗的她而言，只有尽量保持冷静和尽一切可能的小心谨慎，才有可能保障她的命。
所以她没有像当初游戏那样在浅山他们面前现身——她甚至想不起来当初是怎么过的这一段的了。她只是小心翼翼的猫着身子，轻声缓慢地，又迫切地按着原路退了回去。
直到在确保不会被浅山等人注意到的范围外，她才敢直起身子。
浅山他们的事还在继续，邪恶的笑声和痛并快乐的哀叫呻吟，在欣悦身后越离越远。